Untuk memperkuat peran tersebut, DKPP Sumenep memberikan pendampingan melalui penyuluh pertanian. Pendampingan mencakup perencanaan usaha tani, penerapan teknologi budidaya, penggunaan benih unggul, pengendalian organisme pengganggu tanaman, hingga peningkatan produktivitas lahan.
Pendampingan tersebut diarahkan agar pertanian di lingkungan pesantren semakin efisien, mampu beradaptasi dengan perubahan iklim, dan memberikan manfaat ekonomi bagi masyarakat.
Selain pemerintah daerah, pengembangan pertanian pesantren juga mendapat dukungan Bank Indonesia Provinsi Jawa Timur. Dalam kegiatan tersebut, Bank Indonesia memberikan bantuan combine harvester kepada Pondok Pesantren Annuqayah.
