Selain prestasi kelembagaan, siswa-siswi SMP Negeri 3 Besuki juga mencatatkan deretan penghargaan membanggakan. Di antaranya Juara I Sepakbola Puma Cup wilayah barat Situbondo, Juara I Futsal Putra dan Juara III Futsal Putri dalam ajang MGMP PJOK Cup, serta Juara III Bola Basket Putri.
Pada even MKKS Cup SMP se-Kabupaten Situbondo, siswa atas nama Nazwa Kamilatun Nuha meraih Juara I Lomba Tartil dan Noviatun Zahro meraih Juara III Lomba Tahfidz. Untuk bidang akademik, Supriyadi berhasil menjadi finalis Olimpiade Sains Nasional (OSN) IPS tingkat Provinsi Jawa Timur, setelah masuk lima besar tingkat kabupaten.
Di ajang Festival dan Lomba Seni Siswa Nasional (FLS2N), Alya Zulfa meraih Juara I Gambar Ilustrasi, sedangkan tim tari kreasi tradisi dan tim musik tradisional sekolah masing-masing meraih Juara I, serta Juara III untuk kategori musik ansambel campuran. Ketiga tim tersebut akan mewakili Situbondo ke tingkat provinsi.
