Saat ini, lintasan Ketapang-Gilimanuk memiliki tujuh pasang dermaga. Dari jumlah tersebut, sekitar tiga pasang merupakan dermaga tipe landing craft machine (LCM) yang belum dilengkapi kolam pelabuhan secara memadai.
Kondisi tersebut menyulitkan proses kapal bersandar maupun aktivitas bongkar muat, terutama ketika cuaca buruk.
Untuk mengatasi persoalan tersebut, Gapasdap mengusulkan peningkatan kapasitas dermaga hingga mencapai 14 pasang. Penambahan fasilitas itu dinilai penting untuk mengimbangi pertumbuhan mobilitas kendaraan yang melintasi jalur penyeberangan Jawa-Bali.
Terlebih, pengembangan Jalan Tol Trans Jawa yang semakin mendekati wilayah Besuki dan Situbondo diperkirakan turut meningkatkan arus perjalanan masyarakat menuju kawasan timur Jawa.