Meski dapat diobati dengan antibiotik, para ahli kesehatan menekankan bahwa pencegahan tetap menjadi langkah paling efektif. Menjaga kebersihan makanan sebelum dikonsumsi menjadi kebiasaan sederhana yang mampu mengurangi risiko paparan berbagai penyakit bawaan makanan, termasuk cyclosporiasis.
Mencuci buah dan sayuran di bawah air mengalir sebelum dikonsumsi atau diolah merupakan langkah yang disarankan. Bagian buah atau sayuran yang memar maupun rusak sebaiknya dibuang karena berpotensi menjadi tempat berkembangnya mikroorganisme.
Selain itu, kebiasaan mencuci tangan menggunakan sabun sebelum menyiapkan makanan dan setelah menggunakan toilet juga penting untuk mencegah perpindahan kuman maupun parasit. Penggunaan peralatan dapur yang bersih serta penyimpanan bahan makanan pada suhu yang tepat turut membantu menjaga keamanan pangan.
CDC juga mengingatkan masyarakat agar berhati-hati saat mengonsumsi makanan dan minuman di daerah yang memiliki sanitasi kurang baik. Air yang tidak terjamin kebersihannya dapat menjadi media penyebaran berbagai parasit penyebab gangguan pencernaan.
