Soedjono kemudian dikembalikan menjadi anggota DPR. Di sela-sela pekerjaannya jadi anggota parlemen, Soedjono bersama Ali juga menghidupi Centre for Strategic and International Studies (CSIS) dengan mencari dana.
Melihat kedekatannya Soeharto dengan Seodjono, dari bisnis dan masalah dunia kebatinan. Tak heran Soeharto sampai terisak ketika Soedjono dikabarkan meninggal dunia pada 12 Maret 1986 di Tokyo.
