Sebagai filsuf ternyata Ki Ageng Suryomentaraman merupakan keturunan keluarga bangsawan. Dirinya lahir dengan nama Bendara Raden Mas Kudiarmaji pada tanggal 20 Mei 1892 di lingkungan istana.
Dirinya merupakan anak ke 55 Hamengkubuwana VII, sedangkan ibunya adalah salah satu istri selir raja yakni Raden Ayu Retnomandojo, putri Patih Danureja VI. Sedari kecil sudah tampak kecerdasan dari Kudiarmaji.
Seperti putra-putri lainnya, dia menempuh pendidikan setingkat sekolah dasar di Sekolah Srimanganti di dalam lingkungan keraton. Atas saran ibunya, dia kemudian mengambil kursus bahasa Belanda, Arab, dan Inggris.
Dirinya juga mengikuti persiapan dan ujian sebagai Klein Ambtenaar, dan kemudian magang bekerja di gubernuran selama dua tahun. Kudiarmaji gemar belajar dan membaca buku-buku sejarah, filsafat, ilmu jiwa dan agama.